تعود جذور النادي إلى جمعية الجليز الرياضي بجنوب قابس، وهي جمعية متعددة الرياضات أسسها سنة 1973 أحمد الناصفي صاحب مصنع للبلاط، وظل نشاطها محدودًا. وفي سنة 1978 أنشأ مسيّرون من حي المنزل فرعًا لكرة القدم بإشراف المدرب كمال المغربي، فانطلق الفريق في القسم الرابع. وفي 8 ماي 1980 اتخذ اسم المستقبل الرياضي بقابس. وبعد أربع سنوات، بقيادة المدرب علي شبوح، فاز بمجموعة الجنوب في القسم الثاني ثم تجاوز مباريات الفاصلة، ليصبح أحدث فريق يصعد إلى النخبة. وعرف النادي لاحقًا تنقلًا متكررًا بين الأقسام، مع تعاقب سريع للرؤساء وصعوبات مالية متواصلة. وفي عهد رياض الجريدي صعد إلى الرابطة الأولى سنتي 2011 و2014، لكنه نزل في المرتين. وبعد سقوطه سنة 2015، أعادته رئاسة غسان المرزوقي إلى النخبة في 27 ماي 2016. ويرأس النادي منذ سبتمبر 2025 المنجي حسين.