في ظل الحماية الفرنسية كانت الفرق الرياضية بصفاقس منظمة حسب الطوائف، فسعى التونسيون المسلمون إلى تأسيس فريق خاص بهم. وبعد محاولتين فاشلتين سنتي 1912 و1922، أسس الصحفي زهير العيادي النادي التونسي يوم 28 مايو 1928 باللونين الأحمر والأخضر. صعد الفريق إلى القسم الشرفي سنة 1939، ثم إلى القسم الأول سنة 1946 ولم يغادره منذ ذلك الحين. وفي سنة 1962 تغيّر اسمه إلى النادي الرياضي الصفاقسي واعتمد اللونين الأسود والأبيض بفكرة من المدرب ميلان كريستيتش. أحرز أول بطولة وطنية سنة 1969، ثم الثنائي سنة 1971، وتوّج مجدداً بالبطولة سنة 1978. وكان أول نادٍ تونسي يشارك في مسابقة أفريقية سنة 1984، ثم فاز بكأس الاتحاد الأفريقي سنة 1998، وبلقبين عربيين سنتي 2000 و2004، وبكأس الكونفدرالية الأفريقية أعوام 2007 و2008 و2013. وخسر نهائي رابطة الأبطال الأفريقية سنة 2006 أمام الأهلي المصري، وأحرز بطولته الثامنة سنة 2013.